呼吸与危重症医学科原称肺科，成立于1952年，由上海支援内地来到安徽的许学受教授创建，是医院最早获得硕士学位授予权的科室， 2002年度获得安徽医科大学校重点学科。目前科室拥有正高职称7人（50岁以下3人），副高职称4人，中级职称2人；具有博士学位2人，硕士7人。主要学术带头人为博士研究生导师。已培养研究生36名。

本学科由3个专科病区、肺功能室、内窥镜室和200m²实验室组成。拥有多台呼吸机和监护仪，另有纤维支气管镜、胸腔镜、血气分析仪等。年专家门诊量2.5-2.8万人次，年出院1500病人次。科室为安徽省医教研的呼吸专业中心，拥有呼吸系统常见病种及各种疑难杂症，为临床教学和科研打下良好的基础。