泌尿外科是国家临床重点专科建设项目、安徽省重点学科、安徽省临床重点发展学科，泌尿外科博士、硕士授权点，博士后流动站，是安徽省泌尿外科学及男科学主委单位，安徽省泌尿外科专业质控中心及安徽省泌尿外科专科联盟主任单位，安徽医科大学泌尿外科学系主任单位，拥有安徽省泌尿系统疾病临床医学研究中心、泌尿生殖系统疾病安徽省重点实验室、孙颖浩院士工作站，是安徽省规模最大、技术最全面、人才层次最高的泌尿外科中心。

科室成立于1956年，由我国著名的泌尿外科专家陈邦典教授创建，是国内较早建立的泌尿外科专科之一。全科拥有卫生技术人员151名，医生48人，博导4名，硕导9名，博士21名，博士在读6名，硕士27名，硕士学位以上人员达到90%；其中主任医师、教授9名，副主任医师14名，主治医师13名；科研人员及技师共5人；护士98人，主任护师1人，副主任护师2名，主管护师19名。科室包括5个病区（泌尿系结石病区、尿控与男科病区、微创与肿瘤病区、肾移植病区、高新院区综合病区等5个病区）、碎石及尿流动力学检查中心、安徽医科大学泌尿外科研究所、多囊肾诊疗转化中心等，先后获批中华医学会县级医院泌尿结石培训基地（全国19家医院）、中华医学会县级医院泌尿外科腹腔镜培训基地（全国18家医院）、中国前列腺癌联盟（CPCC）前列腺穿刺培训认证中心（全国14家医院）、“司迈等离子前列腺剜除术”培训中心，担负省内外泌尿外科专科医师临床技能培训和示范教学任务。

科室共有床位230张，每年门诊约12万人次，年住院患者8000余人次，年手术量6000余台，微创手术比例90%以上。科室拥有达芬奇机器人、3D及超高清腹腔镜、绿激光、钬激光、EMS碎石清石系统、等离子切割系统、显微手术系统、输尿管软镜等先进设备，有尿动力检查室、体外碎石中心、小手术室及专科临床检查室，硬件设施均为国内一流。常规开展腹腔镜及机器人前列腺癌根治术、膀胱癌根治术、肾部分切除术、经尿道前列腺绿激光及等离子剜除术、经皮肾镜手术、输尿管软镜手术、显微男科手术、肾移植等各类手术，收治省内外转诊疑难病例占住院病人2/3以上，开展新技术、新项目20余项，技术水平为省内领先，国内先进。学科已形成以微创泌尿外科、前列腺疾病、泌尿系肿瘤、泌尿系结石、肾移植、男科、多囊肾早期诊断和治疗等为临床特色的多个发展方向。

近年获国家自然科学基金16项（重点项目1项）、国家临床重点专科建设项目、国家863项目子课题、教育部博士点基金、安徽省自然科学基金、科技攻关项目等课题30余项，获国家、省市等各类资金资助2000余万元，发表学术论文600余篇，其中SCI收录论文100余篇，出版专著10余部，主编《慢性前列腺炎中国专家共识》，参编卫生部本科生、研究生、规培生教材等5部国家规划教材编写，参编《中国前列腺癌联盟-前列腺穿刺指南》、《中国泌尿外科疾病诊疗指南》编写，获安徽省科技进步奖一等奖2项，华夏医学科技奖一等奖1项，安徽医学科学技术奖一等奖1项及中华医学科技二等奖1项，安徽省科技进步奖二等奖2项，三等奖1项。获中国泌尿外科微创领域最高奖-“金膀胱镜奖”1项、中国泌尿外科最高奖-“吴阶平泌尿外科医学奖” 1项、第二届国家名医盛典“国之名医·卓越建树”1人、安徽省首届创新争先奖章1人等多项奖项。

近年科室在国内专科排名逐年上升，2016年度复旦大学排行榜专科声誉获提名（全国20），华东区医院专科声誉排行榜排名第六；2017年度中国医院科技影响力排行榜全国第11名，标志着泌尿外科在临床、科研、教学等方面的发展已达到国内较高水平。